艋舺清水巖地藏殿除了供奉地藏王菩薩、清水巖歷代沙門住持牌位，還有一座對祖師廟歷史來說相當重要的「昭義祠尚義公暨總列神位」。1853年，艋舺發生了台北開發史上影響相當重大的械鬥事件—頂下郊拼。以黃龍安為首的三邑人(泉州晉江、惠安、南安人，合稱三邑，三邑商人，稱做「頂郊」)與林佑藻為首的同安人(同安人主要在廈門做貿易，故稱「廈(下)郊」)為了爭奪艋舺碼頭利益，而發生大規模械鬥事件。而位處三邑與同安聚落(八甲庄)之間，由安溪人所建的艋舺清水巖祖師廟因地處樞紐，因此三邑人為借道攻入八甲庄而先攻艋舺祖師廟。「昭義祠尚義公暨總列神位」即為當時死守清水巖的18位寺廟壯丁之靈位。由於形勢比人強，因此由祖師廟董事白其祥代表交涉，爭取了將廟內神像遷出後才借道三邑人進攻。而艋舺清水巖也在此番鬥爭中被燒毀摧折，直至1867年才得聚足資金重建。
